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基于大數據架構的醫(yī)院數據中心管理

2019-02-15    來源:raincent

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醫(yī)療數據較為復雜,以醫(yī)院來說建設的業(yè)務系統接近百來個,例如HIS系統、急診系統、護理系統、電子病歷系統、檢驗系統、檢查系統、輸血系統、生殖中心系統、體檢系統等,每個業(yè)務廠家不同,設計不同,盡管醫(yī)院都依照不同的主題建立部分分析型數據應用,但還是較為孤立的系統,醫(yī)院也建立了集成平臺,從業(yè)務的角度規(guī)范業(yè)務傳輸,同時在集成平臺基礎上了建立了臨床數據中心,但都不是從醫(yī)院整體數據中心管理為出發(fā)點,都是從數據應用為出發(fā)點。

現大數據技術已逐漸趨于成熟,衛(wèi)生信息化建設也不斷加快,醫(yī)療數據類型、標準和規(guī)模也日益增長,醫(yī)療已全面進入“大數據時代”,怎樣結合大數據技術對醫(yī)院數據進行治理、管理及應用成為關鍵話題,數據中心管理不局限于某個分析主題、科研主題,而不是手工或是后臺數據庫呈現方式,而是利用系統將數據標準、數據中心建立、數據采集、數據校驗、數據分類、管理及應用智能管理起來。

數據中心管理系統建設

建立數據中心管理,規(guī)范數據中心設計,管理采集來源,將醫(yī)院各業(yè)務系統數據有序有量的加載到數據中心庫中,為數據類應用服務提供相應基礎,該平臺利用大數據技術[3]Hadoop中的分布式文件存儲(HDFS)系統保存數據以及分布式實時處理框架(Spark)計算平臺來實現。

系統架構 數據中心管理系統架構見圖1。

 

基于大數據架構的醫(yī)院數據中心管理

 

圖1 數據中心管理系統架構

基礎層:基礎層是指與醫(yī)院數據決策支持平臺有數據交互的系統中的數據,主要是HIS、EMR、PACS、LIS等醫(yī)院業(yè)務系統。從業(yè)務系統抽取、轉換等過程后加載到數據中心;交換層:將kettle封裝到該中心管理系統中,將數據采集到數據中心,將整個采集過程及數據校驗可視化;數據中心管理層:建立標準化管理,數據中心自由構建,將采集方式、數據模型等進行統一管理,建立智能化數據管理平臺,利用分布式存儲技術將數據分為不同的數據中心存儲hbase數據庫中;數據門戶:統一數據輸出管理,針對前端應用的需求,根據不同的需求類型、需求操作范圍、需求的數據范圍、需求操作流程進行管理,對數據實現智能檢索功能;交互層:可將數據放到不同的媒介進行展現,同時可對接醫(yī)院公有云或區(qū)域公有云等。

數據中心管理組件

建立數據中心管理組件,包括基礎資源庫、元數據管理組件、值域代碼管理組件、數據集管理組件、數據抽取及監(jiān)控組件、數據檢驗組件、模型管理組件、指標管理組件等,為數據中心的各種重要功能提供可視化統一管理工具。

基礎資源庫

包括整個平臺從各個業(yè)務系統(HIS、EMR、LIS、PACS)中抽取并集成的各類標準數據信息,例如運營數據中心、臨床數據中心、科研數據中心,采用NoSQL數據庫存儲方式。

元數據管理

元數據是數據中心數據管理功能的基本,是提供數據追溯的最基本單位。元數據管理模塊需要按照標準去制定,有版本管理,所有的數據中心的建立都依賴于標準的元數據。用于定義字段名、字段內部ID,字段類型等,可內置國家標準、省標準或是建立醫(yī)院內部標準,用戶整個數據中心設計的統一管理,同時為互聯互通提供數據標準。

數據集管理

數據集管理主要是管理由元數據組成的不同數據集,例如病人基礎信息、病人醫(yī)囑、病人收費等,主要應用于國家、省等標準集管理,管理相應的版本、與元數據的關系等。

數據中心管理

可通過數據集或數據元自動建立數據中心表,同時對表中元數據的標準、數據類型、來源、來源表、來源字段和目標、目標表、目標字段等進行管理,方便用戶追溯數據的來源及自定義表單。醫(yī)院可通過數據中心管理查詢到醫(yī)院數據標準化程度,同時為數據模型提供來源。

標準字典管理

值域是標準字典允許值的集合,一個允許值是某個值和該值的含義的組合,值的含義稱為值含義。例如,“患者病情狀態(tài)”數據字典的值域是:①危急,②嚴重,③一般。其中①、②和③是值,其值含義分別是危急、嚴重和一般。

標準字典表的基本信息管理包括:類別、元數據類型、值域名稱、值域標識符、定義等,用戶可建立醫(yī)院內部標準字典,或是內置國家頒布,在管理過程中建立標準對照功能主要是將醫(yī)院業(yè)務系統與數據中心定義標準進行值的對照,亦可通過該平臺發(fā)布同步機制,影響業(yè)務系統按照規(guī)定的字典標準統一更新。

數據采集管理

將kettle的采集過程進行可視化管理,主要目的是為了能了解后臺數據抽取邏輯業(yè)務狀態(tài),如:業(yè)務邏輯的執(zhí)行是否成功、業(yè)務邏輯的執(zhí)行日志信息詳情等,本功能可以通過作業(yè)名稱、關聯的分析主題、執(zhí)行時間、完成時間、執(zhí)行狀態(tài)來過濾數據;可以停止/開啟執(zhí)行數據抽取作業(yè);可以手動直接作業(yè),篩選作業(yè)抽取的時間;還可以直接進行數據校驗功能。

數據校驗管理

數據校驗主要是對抽取過來的數據進行一致性及準確性的校驗。

創(chuàng)建數據校驗時維護字段包括:數據校驗名稱、校驗數據庫ID、校驗語句、源數據庫ID、源數據校驗語句。

具體功能實現:可以點擊校驗,篩選校驗開始時間、結束時間;可以停止/開啟執(zhí)行數據抽取作業(yè);可以手動直接作業(yè),篩選作業(yè)抽取的時間,點擊數據校驗,還可以跳轉到數據校驗。

可自動校驗、手動校驗;自動校驗是設定固定時間校驗、校驗時間段(可配置)、如若校驗不一致可自動回退校驗期間的數值進行數據重抽功能。

數據模型管理

利用Saliku在數據中心基礎上建立多個數據應用模型,同時將其模型管理起來,管理模型的關聯關系,模型內部指標集,定義指標來源、出處、規(guī)則、含義等,為規(guī)劃指標統計規(guī)則,為規(guī)范指標的統計規(guī)則及含義,對指標統計進行流程化管理,可在該平臺上申請指標定義及統計規(guī)則,由專人負責審核,完成整個數據流的管理工作,用戶在通過數據模型自由構建報表時可查詢該指標列規(guī)則、出處、內容,同時可點擊校驗該指標數據是否抽取完整。

數據檢索功能

建立可視化數據檢索功能,在數據模型的基礎上,根據用戶權限分配不同的數據權限,用戶可以自由配置篩選條件及所需展現內容。

數據統一管理門戶

為提供統一的數據管理門戶,用戶可在自身的權限范圍內,享受平臺提供的各項應用功能。

權限設置與用戶認證:平臺對用戶應用訪問進行控制,只有包含在受控的用戶列表中的用戶才能瀏覽系統應用,系統根據不同的用戶權限展示允許范圍內的報表信息;用戶類型分組:為了控制平臺應用服務的訪問權限,將系統用戶劃分為不同的類型,如:管理員、科研人員、管理者等。不同的用戶類型享用不同的應用服務,也就是對查詢信息擁有不同的訪問權限;數據對外管理:當其他系統調用數據中心時,[請確認修改]管理其數據去向、數據權限、數據安全;數據日志管理:對數據訪問痕跡,數據日志,數據修改,數據報表建立等進行相應管理;數據應用類系統:將數據相關應用類產品實現統一的單點登錄,如科研管理、院長平臺、藥學管理、醫(yī)?刭M、單病種管理等;首頁個性化設定:用戶可根據修改系統膚色及、可自由配置首頁、組合所關注的特定報表、特定功能菜單。

作者:佚名來源:中國數字醫(yī)學

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