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糖尿病數(shù)據(jù)的可視化分析

2018-07-31    來(lái)源:raincent

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最近,國(guó)產(chǎn)電影《我不是藥神》正在上映,這部根據(jù)真實(shí)性故事改編的電影,通過(guò)對(duì)病人群體的描寫,引發(fā)了社會(huì)對(duì)于醫(yī)療問題的大討論。作為一位長(zhǎng)期關(guān)注臨床健康問題的統(tǒng)計(jì)學(xué)家,數(shù)據(jù)科學(xué)家 John Yap 希望用數(shù)據(jù)可視化的方式,幫助人們更好地認(rèn)識(shí)疾病。這次,他把目光聚焦在了糖尿病問題上。

疾病是人類生活的一部分。我們的歷史上一直不斷和疾病抗?fàn)帲簭墓?30年在雅典爆發(fā)的天花到最近幾年肆虐美洲大陸的寨卡病毒。幸運(yùn)的是,科技發(fā)展給現(xiàn)代醫(yī)學(xué)帶來(lái)的治療方法的變革,已經(jīng)幫助人們?nèi)〉昧丝範(fàn)幖膊〉母咝У姆椒。而臨床試驗(yàn)就是這些科學(xué)方法的核心。

臨床醫(yī)學(xué)對(duì)糖尿病的治療帶來(lái)很大幫助。我制作了這個(gè)R Shiny app原型(你還可以登錄我的 Github頁(yè)面查看源代碼,自己做一些更多的探索),它的目標(biāo)是對(duì)美國(guó)的糖尿病臨床研究信息,這些信息可以用在以下情況:

•  糖尿病患者對(duì)參與新藥物、新治療方法的臨床試驗(yàn)感興趣,或者想在未來(lái)第一時(shí)間知道臨床研究的新消息;

•  你對(duì)藥物學(xué)感興趣,并且想了解更多有關(guān)現(xiàn)實(shí)中的臨床試驗(yàn)的知識(shí);

•  你是醫(yī)療工作者,想要了解臨床實(shí)驗(yàn)的贊助商們,以及可能影響到你所在機(jī)構(gòu)的臨床試驗(yàn)的最新進(jìn)展;

•  你對(duì)投資藥物研究感興趣,想要了解贊助數(shù)據(jù)、產(chǎn)品生產(chǎn)數(shù)據(jù)等;

這個(gè)項(xiàng)目的靈感來(lái)自 Xiao Jia 之前的一個(gè)項(xiàng)目。數(shù)據(jù)集來(lái)自 ClinicalTrials.gov,一個(gè)存儲(chǔ)美國(guó)和世界各國(guó)臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)的網(wǎng)站,資源來(lái)自美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書館。

為了創(chuàng)建一個(gè)App,我的研究?jī)H僅局限在一種特定的疾病(糖尿病),贊助商只包含美國(guó)本土的機(jī)構(gòu),而且以兩個(gè)主要的研究類型(臨床試驗(yàn)和觀察性研究)為主。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),臨床試驗(yàn)通常是在一種藥物或治療方式推向公眾之前,小范圍進(jìn)行的測(cè)試。而觀察性研究則是在藥物已經(jīng)上市后,進(jìn)行的安全性評(píng)估。

App主頁(yè)面上有五類信息:簡(jiǎn)介,研究信息,年度數(shù)據(jù),贊助數(shù)據(jù)以及地圖。簡(jiǎn)介是以視頻形式呈現(xiàn)。研究信息會(huì)展示比如贊助類型、糖尿病種類、治療模式、研究進(jìn)展等特定信息,以柱狀圖呈現(xiàn)。基于這個(gè)功能我得出一些發(fā)現(xiàn):

•  糖尿病的臨床試驗(yàn)數(shù)量多于觀察性研究的數(shù)量;

•  研究通常來(lái)自醫(yī)藥公司等行業(yè)內(nèi)公司以及其他機(jī)構(gòu)(一些學(xué)術(shù)或非盈利組織贊助);

•  最常見的干預(yù)類型包括藥物干預(yù),行為干預(yù)以及器械干預(yù)。

 

 

 

 

年度數(shù)據(jù)的功能展示了每年開始或完成的研究數(shù)。如果我們看一看不同年份開始的研究數(shù)據(jù),會(huì)發(fā)現(xiàn):

•  大多數(shù)研究是由行業(yè)或者其他(研究機(jī)構(gòu)、非營(yíng)利組織)機(jī)構(gòu)來(lái)資助的

2000年到2010年間,由行業(yè)或其他機(jī)構(gòu)資助的臨床試驗(yàn)陡增。一個(gè)可能的原因是糖尿病在這幾年成為一個(gè)嚴(yán)重的公共安全隱患,引發(fā)更多的研究。

2010年之后,由行業(yè)資助的研究數(shù)下降,由其他機(jī)構(gòu)資助的保持不變。這可能意味著行業(yè)內(nèi)不再認(rèn)為研究糖尿病的治療能夠帶來(lái)商業(yè)回報(bào)?這個(gè)現(xiàn)象值得深入研究。

 

 

贊助數(shù)據(jù)以表格形式展示,對(duì)不同贊助商的數(shù)據(jù)進(jìn)行收集整理。表格包括每個(gè)贊助商資助的研究數(shù),以及參與者(參與總數(shù)、平均值、最小及最大值)和時(shí)長(zhǎng)(平均值、近幾年的最小和最大值)的概況。從中你會(huì)發(fā)現(xiàn):

•  資助項(xiàng)目最多的10個(gè)贊助商中,7個(gè)來(lái)自行業(yè)內(nèi)

•  AstraZeneca資助了最多的研究(168項(xiàng))

•  國(guó)家糖尿病、消化系統(tǒng)及腎臟系統(tǒng)疾病協(xié)會(huì)排名前三

 

 

在地圖的功能上,我們展示了贊助商在全國(guó)的分布情況。你可以選擇查看不同的研究類型并放大地圖查看。最初的地點(diǎn)標(biāo)示以塊狀展示,當(dāng)你放大后會(huì)分散開,顯示更具體的信息。這可以讓你看到自己所在區(qū)域是否有相應(yīng)的臨床試驗(yàn)。

 

 

這個(gè)app僅僅用了兩周左右時(shí)間完成。如果有更多時(shí)間和精力,它可以在以下方面得到提升:

•  將其他疾病也納入其中

•  將美國(guó)以外的贊助商也納入其中

•  將更多研究類型,比如注冊(cè)研究等納入其中

另外還可以加入更多的功能,比如顯示疾病發(fā)生所在地信息、受資助的臨床試驗(yàn)的進(jìn)展階段。這些額外的功能能夠幫助想要長(zhǎng)期投資藥物領(lǐng)域的投資者更好地選擇贊助商。這會(huì)提高App的商業(yè)價(jià)值。

(本文編譯自技術(shù)博客 Visualizing Diabetes Clinical Studies Data 僅代表作者觀點(diǎn)。)

John Yap是一名在臨床試驗(yàn)以及觀察性研究方面有多年工作經(jīng)驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)學(xué)家。

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